共聚焦顯微鏡系統可以對樣品做連續光學切片并排除非焦平面的信號干擾,為此共聚焦顯微鏡的應用也的確更為普遍。共焦的方法提供了便利有用得多成像的活標本,使三維數據的自動收集,并改善使用多個標簽的標本獲得的圖像。 圖3給出了比較傳統的螢光影像碘化丙啶染色的蝴蝶蛹翼上皮整裝類似地區的共聚焦圖像。 原子核在物流及供應鏈管理應用技術研發中心圖像的分辨率,由于消除焦熒光耀斑有一個顯著的改善。
共聚焦顯微鏡系統的設計通常是試樣進行掃描的方法,通過該方法的基礎上。 兩個基本的掃描裝置掃描的階段或照明光束,并且有至少有兩個根本不同的光束掃描的方法。圖像串行內置的光電倍增管的輸出或使用一個裝有電荷耦合器件的數字相機,直接處理在計算機成像系統,一個高的的分辨率的視頻監視器上顯示的拍攝,并輸出硬拷貝設備,以優異成績。
共聚焦顯微鏡系統在以下研究領域中應用較為廣泛:
1、細胞生物學:細胞結構、細胞骨架、細胞膜結構、流動性、受體、細胞器結構和分布變化、細胞凋亡;
2、生物化學:酶、核酸、FISH、受體分析 ;
3、藥理學:藥物對細胞的作用及其動力學;
4、生理學:膜受體、離子通道、離子含量、分布、動態;
5、遺傳學和組胚學:細胞生長、分化、成熟變化、細胞的三維結構、染色體分析、基因表達、基因診斷;
6、神經生物學:神經細胞結構、神經遞質的成分、運輸和傳遞;
7、微生物學和寄生蟲學:細菌、寄生蟲形態結構;
8、病理學及病理學臨床應用:活檢標本的快速診斷、腫瘤診斷、自身免疫性疾病的診斷;
9、生物學、免疫學、環境醫學和營養學。
現在共聚焦顯微鏡系統正不斷向更快速、更靈敏、更高分辨率及更好的可擴展性發展,不斷有新技術誕生。速度方面,有共振快速掃描頭及轉盤共聚焦;靈敏度方面有分光系統及更靈敏的檢測器;分辨率方面有超高分辨率;此外還有多光子、白激光、SMD等技術。